ARNm Cap2'-O-Metiltransferasa
El ARNm Cap 2´-O-metiltransferasa se derivó de una cepa recombinante de E. coli que porta el gen del ARNm Cap 2´-O-metiltransferasa de vaccinia.Esta enzima agrega un grupo metilo en la posición 2'-O del primer nucleótido adyacente a la estructura de la tapa en el extremo 5' del ARN. La enzima utiliza S-adenosilmetionina (SAM) como donante de metilo para metilar el ARN tapado (tapa -0) dando como resultado una estructura cap- 1.
La estructura Cap1 puede aumentar la eficiencia de la traducción, mejorando la expresión del ARNm en experimentos de transfección y microinyección. Esta enzima requiere específicamente ARN con una tapa m7GpppN como sustrato.No puede utilizar ARN con pN, ppN, pppN o GpppN en el extremo 5'.El ARN protegido se puede preparar mediante transcripción in vitro utilizando un análogo de protección o mediante protección enzimática utilizando la enzima limitadora de Vaccinia.
Componentes
ARNm Cap 2´-O-Metiltransferasa (50U/μL)
10 × tampón de reacción de limitación
Almacenamiento
-25 ~- 15 ℃ para almacenamiento (evite ciclos repetidos de congelación y descongelación)
Búfer de almacenamiento
Tris-HCl 20 mM (pH 8,0, 25 ℃), NaCl 100 mM, DTT 1 mM, EDTA 0, 1 mM, Triton X-100 al 0, 1%, glicerol al 50%.
Definición de unidad
Una unidad se define como la cantidad de enzima necesaria para metilar 10 pmoles de un transcrito de ARN protegido de 80 nt en 1 hora a 37°C.
Ensayos de control de calidad.
exonucleasa:50 U de ARNm Cap 2 ´ -O-Metiltransferasa con 1 μg de ADN digerido con λ-Hind III a 37 ℃ durante 16 horas no produce degradación, según lo determinado mediante electroforesis en gel de agarosa.
endonucleasa: 50 U de ARNm Cap 2 ´ -O-Metiltransferasa con 1 μg de λADN a 37 ℃ durante 16 horas no producen degradación, según lo determinado mediante electroforesis en gel de agarosa.
Nickase: 50 U de ARNm Cap 2 ´ -O-Metiltransferasa con 1 μg de pBR322 a 37 ℃ durante 16 horas no producen degradación, según lo determinado mediante electroforesis en gel de agarosa.
ARNasa: 50 U de ARNm Cap 2 ´ -O-Metiltransferasa con 1,6 μg de ARN MS2 durante 4 horas a 37 ℃ no producen degradación, según lo determinado mediante electroforesis en gel de agarosa.
E. coli ADN: Se analizan 50 U de ARNm Cap 2 ´ -O-Metiltransferasa para detectar la presencia deE. coli ADN genómico utilizando TaqMan qPCR con cebadores específicos para elE. coli Locus de ARNr 16S.ElE. coli La contaminación del ADN genómico es =1.E. coli genoma.
Bacteriano endotoxina: Prueba LAL, según la Farmacopea China IV edición 2020, método de prueba de límite de gel, regla general (1143).El contenido de endotoxinas bacterianas debe ser = 10 UE/mg.
Sistema de reacción y condiciones.
1. Combine una cantidad adecuada de ARN tapado y H2O libre de ARNasa en un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml hasta un volumen final de 16,0 µL.
2. Calentar a 65 ℃ durante 5 minutos seguido de un baño de hielo durante 5 minutos.
3. Agregue los siguientes componentes en el orden especificado (para la metilación del ARN protegido
menos de 10
Componente | Volumen |
ARN con tapa desnaturalizada | 16 µL |
Tampón de reacción de limitación 10X* | 2 µL |
SAM (4 mm) | 1 µL |
ARNm Cap 2´-O-Metiltransferasa (50 U/μL) | 1 µL |
ddH2O | A 20 µL |
*10× Tampón de reacción de limitación: Tris-HCl 500 mM (pH 8,0, 25 ℃), KCl 50 mM, MgCl2 10 mM, DTT 10 mM.
4. Incubar a 37 ℃ durante 1 hora (se recomiendan 2 horas de incubación para el fragmento objetivo de menos de 200 nt).
Aplicaciones
Mejorar la expresión de ARNm durante experimentos de microinyección y transfección.
Notas de uso
1. Antes de la reacción, el ARN debe purificarse y disolverse en agua libre de nucleasas; todas las soluciones no deben contener EDTA ni iones.
2. Se recomienda calentar la muestra de ARN a 65 ℃ durante 5 minutos antes de la reacción para eliminar la estructura secundaria en el extremo 5' del transcrito.Podría ampliarse a 10 min para una estructura compleja de 5 ´-terminales.